生物化工技術(shù)是我國化工行業(yè)實現(xiàn)生產(chǎn)方式變革、產(chǎn)品結(jié)構(gòu)調(diào)整與清潔高效制造的有效手段。“十一五”期間，我國加大了對生物化工技術(shù)領(lǐng)域的科研投入，在生物催化劑定向改造、規(guī)模化的生物催化技術(shù)系統(tǒng)、生物材料和生物能源等領(lǐng)域取得重要成果。目前我國已形成了現(xiàn)代生物工業(yè)產(chǎn)業(yè)群，生物塑料、生物能源、生物基化工材料等產(chǎn)業(yè)快速發(fā)展。

    “十一五”期間我國在纖維素乙醇研發(fā)領(lǐng)域已與世界先進(jìn)水平同步，建成多個大型燃料乙醇和生物柴油示范項目。我國第一個年產(chǎn)1萬噸纖維乙醇示范裝置2008年在河南天冠集團(tuán)公司開始運行；天津大學(xué)與廣西中糧建成目前世界上單套規(guī)模最大的20萬噸/年木薯燃料乙醇生產(chǎn)裝置；長春大成集團(tuán)實施玉米淀粉糖、系列變性淀粉與多元醇開發(fā)及產(chǎn)業(yè)化示范項目，在國際上首次建成了20萬噸生產(chǎn)線；吉林松原來禾化學(xué)有限公司以中科院過程所的技術(shù)為依托，建成國際領(lǐng)先的30萬噸/年秸稈煉制工業(yè)生產(chǎn)線。在微藻制生物柴油領(lǐng)域，中科院青島生物能源與過程研究所篩選了產(chǎn)油微藻藻株，大大降低了成本。

    在生物催化劑定向改造和酶法生產(chǎn)生物柴油領(lǐng)域，北京化工大學(xué)開發(fā)出以脂肪酶為催化劑的綠色化學(xué)合成工藝，開發(fā)了新的脂肪酶固定化技術(shù)，成功實現(xiàn)了我國酯化用脂肪酶的產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)。目前擁有我國自主知識產(chǎn)權(quán)的國內(nèi)首家酶法年產(chǎn)10萬噸生物柴油產(chǎn)業(yè)化項目已在秦皇島啟動。

    “十一五”期間，我國在生物質(zhì)基高分子新材料技術(shù)及產(chǎn)品的研究開發(fā)也取得重大成果，獨創(chuàng)了木質(zhì)纖維素有機(jī)酸分離技術(shù)體系，成功開發(fā)出高性能離子交換樹脂等新型功能材料；在聚乳酸領(lǐng)域，采用我國開發(fā)的綠色無溶劑本體聚合核心技術(shù)與生產(chǎn)裝備的聚乳酸生產(chǎn)線，成功制備出性能達(dá)到國外同類產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)的國產(chǎn)聚乳酸；PHA方面，我國目前年總產(chǎn)能超過1.5萬噸，國PHA產(chǎn)業(yè)化種類和產(chǎn)量都處于國際領(lǐng)先地位，萬噸級PHA裝置已經(jīng)成功試車。

     在規(guī)模化生產(chǎn)的生物催化技術(shù)領(lǐng)域，由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院等單位完成的微生物農(nóng)藥發(fā)酵新技術(shù)新工藝及重要產(chǎn)品規(guī)模應(yīng)用項目，大幅度提高了阿維菌素、Bt、中生菌素的發(fā)酵水平；浙江工業(yè)大學(xué)開發(fā)出井岡霉素生物催化大規(guī)模生產(chǎn)井岡霉醇胺的方法，實現(xiàn)了井岡霉醇胺和高純度井岡霉素的規(guī)模化生產(chǎn)；中科院微生物研究所開發(fā)的用微生物發(fā)酵法生產(chǎn)長鏈二元酸技術(shù)，使我國成為世界惟一能夠利用生物合成法工業(yè)生產(chǎn)長鏈二元酸的國家。

    在清潔轉(zhuǎn)化介質(zhì)創(chuàng)制領(lǐng)域，清華大學(xué)等開發(fā)出一體化膜生物反應(yīng)器成套設(shè)備，將膜分離技術(shù)與生物技術(shù)有機(jī)結(jié)合的新型廢水處理技術(shù)可以實現(xiàn)從污水處理到再生水的轉(zhuǎn)變。該項目開發(fā)的低能耗膜-生物反應(yīng)器和膜組件單元運行通量明顯提高，目前世界上規(guī)模最大的膜生物反應(yīng)器河水凈化工程在北京順義新城溫榆河水資源利用工程（10萬噸/天）獲得應(yīng)用。我國還開發(fā)出以農(nóng)產(chǎn)品加工廢棄物為原料的可降解生物基高吸水性樹脂，這種農(nóng)用保水劑產(chǎn)品目前已在新疆、廣東、內(nèi)蒙古等地應(yīng)用推廣。